在重整原料中，除硫、氮等杂原子化合物外，常常还含有下述一些金属有机化合物：含砷化合物、含铜化合物和含铅化合物等。
（1）含砷化合物
重整原料油中含有多少种砷的化合物尚不太清楚，砷化物的结构状态也尚未深入研究。但是砷对催化重整过程的严重危害，在国内外催化重整技术发展过程中有过教训，已经证实砷（As）能与铂（Pt）生成PtAs化合物，使催化剂丧失活性，而且不能再生，即是重整催化剂的永久性中毒的毒物。因此，对砷的要求很严格，通常重整进料含砷量不得大于1PPb。各种重整原料油中的砷含量为几十～几万PPb，对于含砷高的重整原料在预加氢反应器之前还需设预脱砷反应器。
（2）含铜、含铅化合物
含铜、含铅化合物与含砷化合物一样，也是重整催化剂的永久性中毒的毒物（不能再生）。各种不同来源的重整原料中都含有微量的含铜、含铅化合物，大庆直馏汽油中的铜、铅含量比砷低得多，而且，在原料预脱砷或加氢预精制的同时，也能被脱除。