阻遏系统：是色氨酸生物合成途径的第一调控，主管转录是否启动。
当色氨酸过量时，它与阻遏蛋白形成复合物，并结合到操纵基因上阻止结构基因转录，即以终产物组织基因转录。
弱化系统：第二水平控制，它决定着已经启动的转录是否能继续进行下去。当mRNA合成起始以后，除非培养基中完全没有色氨酸，否则转录总是在前导区内终止。转录终止发生的区域称为弱化子或衰减子。前导区可分为四个区域，这四个区域的片段以两种不同的方式进行碱基配对，由核糖体经过前导区继续翻译的功能控制着这两种结构的转换，它决定mRNA是否形成终止所需的结构，从而产生弱化效应。