1、阳双层床，最好用盐酸再生。如用硫酸再生，在树脂层中，容易析出CaSO4沉淀。
双层床，要注意防止胶体硅的沉积。因为制水时，强碱性阴树脂吸附了大量硅酸。再生时，由于碱液首先接触这一层树脂，势必在废液中含有大量硅的化合物。当这种废液接角弱碱性阴树脂时，因弱碱性阴树脂吸附了OH-，使废液的PH值下降，有可能形成部分胶体硅酸。一旦形成胶体硅酸沉积在弱碱性阴树脂层中，将使再生后的清洗产生困难，影响交换时出水的水质。且在下一周期制水时，它又可能被强碱性阴树脂吸着，从而减少了设备的周期制水量
3、为防止双层床逆流再生中胶体硅酸的析出，可先用1%浓度的NaOH以较快的流速再生，这时，转换出来的硅酸量不多，但能使弱碱性阴树脂得到初步再生，并使树脂层呈碱性。然后用用3~4%NaOH以较低的流速再生，这样可避免因PH值降低而析出胶体硅酸。
4、采用双层床时，所用水源的水质必须稳定，否则会使经济性及出水水质降低。这是因为双层床中两种树脂的比是固定的，当水质变动时，它不能自动适应。一般弱碱性或弱酸必树脂层，应占树脂层总高度的40~50%。