医院药学最鲜明的特点是医药结合性和实践性。
（1）医院药学是医疗保健工作的重要组成部分。临床医学、医院药学和护理学是医院三大支柱学科，缺一不可。据统计，在疾病的治疗中70％以上的疗效是靠药物治疗获得的，因此在临床诊断明确的情况下，如何选择药品和使用药品就成为最重要的问题。这既是医师的责任，也是药师的责任。医药紧密结合，在提高医疗、诊断水平的同时，提高药物治疗水平，药师责无旁贷。
（2）医院药学是药物前期科研开发生产过程的终点。药品作为防病治病的特殊商品，有其极其严格的研制、生产、流通过程，最后进入医院临床使用环节。医院药学与其他药学学科的主要区别在于医院药学直接服务于病人，能否向病人提供合格的药品制剂和良好的药学服务，是检验医院药学水平的试金石。
（3）医院药学是药学与临床医学的交汇点。随着临床药学工作的不断深入和药学保健（pharmaceuticalcarE.模式的出现，医院药学与临床医学的结合将越来越密切，其学科的实践性越来越明显。医院药师必须走出药房，走进实验室，投身于临床医学，与医师、护士一起，充分发挥团队作用。具体来说，医院药学应从过去面向药物（oriented-drug）转为面向病人（oriented-patient），医院药师应从单纯药品供应转向药学技术服务。为了完成上述转变，在为病人治疗的过程中，药师与医师共同在治疗现场，各施其能，互为补充，以期获得最佳治疗效果。
（4）医院药学是药事工作纵向管理与横向管理相结合。医院药事管理有两个方面内容。一是对药剂科（药学部）的自身管理，即纵向管理。它是利用现代管理学的原理和方法研究医院药学工作规律，达到优化组合，提高工作效率，调动全体药学工作者的积极性，保证医院药事工作的顺利完成。二是对全院药品管理，即横向管理。横向管理主要是贯彻、监督国家有关药政法规在全院顺利实施，保证药学部门管理职能的真正落实。纵横交叉融为一体，相辅相成，使全院药品管理工作正常有序。