南京国民政府建立后，国民党保留了广州和武汉国民政府的“党治”模式，将之加以完善，显现出党治国家的基本特征。1928年2月4日的国民党二届四中全会规定国民政府在国民党中执会指导监督下掌握全国政务，政府委员由国民党中执委推举。1931年6月1日公布的《中华民国训政时期约法》，以宪法形式将“以党治国”的政治体制加以确认。此外，国民党始终掌握着军队的最高权力，由于军队是国民党存在的基石，所以蒋介石以党军统帅而成国民党政治领袖，并进而控制国民政府，这是南京国民政府时期政治发展最显著的特征。
通过对行政权力的掌握，国民党从中央到地方建立了一套与行政体系平行但却高于其上的管理体制，这种附着于行政权力体系之上的党的基层机构，广泛的建立于社团、文化、教育机构、产业、商业中，甚至连海外的华侨组织也可见其踪，这种体制的运行，通过行政权力施加国民党的影响，渗入社会生活的各方面。