遗传标记是指能够用以区别生物个体或群体及其特定基因型、并能稳定遗传的物质标志。动物遗传标记的发展经历了以下过程：
１.形态学标记：是指能够用肉眼识别和观察、明确显示遗传多样性的外观性状。如动物的毛色、角形、耳型等。形态学标记简单直观，但数目少，多态性低，容易受环境影响。
２.细胞遗传标记：主要是指染色体核型、带型和数量特征的变异，它们分别反映了染色体在结构和数量上的遗传多样性。细胞遗传标记与形态学标记相比，虽然不易受环境的影响，但很难获得，从而限制了它的应用。
３.免疫遗传标记和生化遗传标记：免疫遗传标记是以动物的免疫学特征为标记，包括红细胞抗原多态性和白细胞抗原多态性。生化遗传标记主要是指在同一动物个体中具有相同功能的蛋白质存在两种以上的变异体。免疫遗传标记和生化遗传标记反映的是基因表达产物的多态性，也就是反映基因组编码区的遗传信息，而不能反映非编码区的遗传信息。
４.分子遗传标记：是一种新的以DNA多态性为基础的遗传标记，能反映整个基因组的遗传信息，标记数量多，多态信息含量高。