监督项目：膜堆的电流和电压。根据进、出水的质量，确定工作电流，工作电流一般为极限电流的90%，以防止极化产生而又保持较高的效率。根据选定的电流来控制电压，不能因为电流的下降就盲目地增加电压。
通常需保证入口水的SDI≤5。根据设备厂家的规定或调试的情况，确定倒极的周期、酸洗的间隔和极室加酸的间隔。
浓淡水应按照一定的比例进行控制，保证淡水侧的压力略高于浓水侧的压力。对于浓水再循环的电渗析，补充的入口水量应和排出的浓水量相同或略高一些，控制浓缩分辩率以免产生结垢。
在运行中还应检查设备有无漏水、变形等现象，监督进出水的电导率，PH值、浓水、极水加酸量。