1）组织拟制本科室（含亚专科）中长期建设发展规划、年度工作计划和科室专项管理制度；2）组织本科室落实医疗工作各项规章制度和技术操作规范；3）组织本科室落实为部队官兵、老干部和保健对象服务工作的各项规定；4）安排本科室人员的业务工作；5）组织领导本科室人员开展诊疗、护理和心理服务等工作，解决本科室复杂、疑难技术问题；6）负责本科室重大手术、特殊检查、医疗文书和紧缺、贵重、新特药品使用和输血的审签；7）组织本科室伤病员术前，以及疑难、危重、死亡病例和合理用药的讨论；8）组织安排好亚专科及高中级医师的临床和教学工作，每周组织2次查房，并对危重和大手术前后的伤病员进行医疗质量和安全把关；9）组织本科室大力开展新业务、新技术，引进、吸收、消化先进技术，积极进行原始创新，落实信息化应用项目；10）负责本科室医疗质量和医疗安全管理，积极妥善处理各类医疗纠纷和事故；11）组织领导本科室含聘用人员的医疗教学、科研、业务训练、技术考核和管理工作；12）上级赋予的其他职责。
注：科室副主任在科室主任的领导下，协助科室主任工作。