（1）行政机构方面，明太祖为加强对地方控制，废行省，设三司(承宣布政使司、提刑按察使司、都指挥使司)，分管地方行政、司法、和军政。三司长官互不统属，直接对皇帝负责。在中央，明太祖借口胡惟庸案，撤销中书省和丞相，把相权分给六部，还设殿阁大学士，备皇帝顾问，影响：丞相的废除意味着皇权的进一步加强。从体制上保证了君主的绝对权威；明成祖时，形成内阁制度，中央和地方的政权完全由皇帝控制。
（2）军事机构方面，在中央，明太祖设五军都督府，与兵部共管兵权，相互牵制。明太祖又创立了卫所制度，各卫、所分属于各省的都指挥使，统由中央五军都督府管辖。影响：使兵部、都督府和卫所总兵将官都不能专军权，军权集中在皇帝手里。
（3）监察机构方面，明太祖改御史台为都察院，作为中央监察机关。都察院与中央司法机关大理寺、刑部合称“三法司”。“三法司”不能决断的案件，由皇帝裁决。为了监视官吏和镇压人民反抗，明太祖设立锦衣卫，明成祖时设立“东厂”，明朝中期又设立“西厂”，锦衣卫、东厂、西厂都是特务机构，合称“厂卫”，明朝还有一种叫“廷杖”的刑罚，即皇帝在殿廷杖责官员。影响：使国家司法权集中在皇帝手里，厂卫机构的设立是明朝君主专制空前加强的表现。
（4）在科举考试方面，明政府规定只准在四书、五经内命题，应考者不许发挥独立见解，文体为“八股文”。影响：八股取士束缚了知识分子的思想，加强了封建君主专制。
（5）赋役制度。为了加强对人民的控制和保证赋役来源，明太祖清查户口，丈量土地，编制了“黄册”和“鱼鳞图册”。黄册是户口清册；鱼鳞图册是耕地清册。明政府根据黄册和鱼鳞图册，把人民束缚在土地上，进行赋役剥削。