《保密法》和《保密法实施办法》对我国保密工作管理体制的规定，体现了以下四个原则：
一是政府职能机构管理保密工作的原则。根据《保密法》规定，国家和地方各级政府的保密工作部门，是国务院和地方各级政府主管保密工作的职能机构。国家保密工作部门即国家保密局主管全国保密工作，地方各级政府保密工作部门即各级政府的保密局，是各级政府主管本行政区域保密工作的职能机构，在它的职权范围内，它可以代表地方各级政府决定、处理有关保密工作事务。
二是属地和系统管理的原则。属地管理，即块块管理。就是说，凡在该行政区域内的机关、单位，除军队和某些有特殊要求的部门外，其保密工作一律归该地区的保密工作部门管理。系统管理，即条条管理。就是说，中央国家机关的保密工作机构，在其职权范围内，主管或者指导本系统的保密工作。
三是业务工作管理与保密工作管理相结合的原则。这一原则主要是对业务管理部门提出保密管理的要求。根据《保密法》第六条规定，县级以上国家机关和涉及国家秘密的单位，应根据实际情况设置保密工作机构或者指定人员，管理本机关和本单位保守国家秘密的日常工作。业务管理部门主管什么业务，就要主管什么业务中的保密工作，业务工作管到哪里，保密工作就要管到哪里。
四、协调配合原则。遵照这一原则，中央与地方之间、地区与地区之间、部门与部门之间，在处理保密工作事务、查处泄密事件中，要相互协调、相互配合。