首先，行政良心在行政人员的行政行发生之前，会对行为动机的选择起调控作用。行政人员在作出某种行政行为选择之前，由于行政良心的作用，总会使他根据自己所内化的责任和义务的要求，去衡量和检查动机在道德上的纯洁性。凡是断定符合行政管理职业道德要求的动机，在心理上就会得到肯定；反之，就会形成一种心理上的不安感或不满意的感受。
这种正反心理体验就会促使行政人员去修改、放弃或端正原有的不良动机。
其次，在行政行为中，行政良心对行政行为取向的变化起监督和控制作用。行政良心作为行政人员内心深处的“调控器”，总会像“警察”一样伴随行政行为的全过程，并构成一道强有力的心理防线。当行政行为保持正确的方向时，它会给以内在的激励和支持；当行政行为的方向发生偏离，违背了承担行政管理职业责任和义务的要求时，它会以内在愤怒的心理方式加以制止和克服。
第三，在行政行为选择已经完成的时候，行政良心会对行为后果起反思和评价的作用。行政人员的行政良心是其行政行为的裁判者。拥有行政良心的行政人员，能自觉地在良心法庭上自己既当起诉人又当审判官，认真检查和审判自己的言行。当发现自己的行为符合道德要求时，内心便会感到欣慰和满足；当发现自己的行为违背道德要求时，内心就会受到谴责，深感内疚、不安和痛苦，或羞愧得无地自容，决定改正自己的行为。