①系统优化原则
找矿靶区优选的目的是对找矿靶区进行选尤弃劣，实现由面到点、面中求点，从而使靶区见矿概率和潜在社会经济价值大小分明。因此，优选过程中所涉及的各方面信息、标志、工作程序和方法的选择都应该是优化的，才能从整体上保证系统优化的实施，保证所划分的高级别远景区具有最小的面积、最大的见矿概率和潜在的利用价值。
②综合评判原则
优化过程中必须结合各方面的影响因素进行全面地综合对比，必须时刻清醒地认识到现阶段矿产资源的勘查与开发是社会经济生产活动的一部分，其最终提交给社会的矿产品是一种特殊的商品。因此，靶区优选中不仅要考虑成矿有利度的大小，还必须考虑到可能影响勘查及开采效益的所有因素，以尽可能地降低勘查工作的风险性。