人工鱼礁指为改善水域生态环境，诱集鱼类栖息或繁殖，在水中设置的固定设施。人工鱼礁的功能主要表现在环境、集鱼和资源保护三个方面。
（1）鱼礁的环境功能。体现在鱼礁内部以及周围区域的非生物环境和生物环境的变化。鱼礁对其周围以及内部的流速流态直接产生影响，同时，海中设置鱼礁后，周围光、味、音环境也发生变化。鱼礁投放后形成的上升流，使上、下层水体之间交换比较活跃，表层高氧海水容易潜入到下层，甚至底层；而下层富于营养的海水则容易上升到上层，这样就形成了海洋初级生产力较为繁盛的区域。同时，鱼礁本身作为一种基质，附着生物开始在其表面着生，鱼礁周围的底栖生物和浮游生物的种类、数量、分布发生变化。结果为鱼礁海域的生物量增大。
（2）鱼礁的集鱼功能。鱼礁的多洞穴结构及礁体内部和周围形成几何阴影区，给许多鱼类尤其是幼鱼提供了阴蔽避敌场所，鱼礁表面的附着生物及周围繁生的多种生物，培养了许多鱼类赖以生存的饵料生物，诱集鱼类索饵和栖息，并吸引凶猛鱼类和大型捕食性鱼类也到鱼礁周围索饵。由此，鱼礁为各种不同的鱼类提供了索饵、避害、产卵、定位的场所，而不同营养层的物种聚到鱼礁周围，确定了聚集于鱼礁的生物之间的食物链关系，形成了一个小型的人工生态系。
（3）鱼礁的资源保护功能。鱼礁的礁体内空间可保护生物幼体，同时，鱼礁可作为水下障碍物，用以限制某些渔具（等拖网、围网和刺网）作业，从而保护渔场环境，并促使水产资源增殖。另外，利用人工鱼礁对藻类的吸附作用、鱼礁附着生物的滤食作用、鱼礁区大量生物摄食对赤潮引发因子的抑制作用，以及水泥预制礁体阻碍海底有机物的释放等功能机理，可降低水体富营养化程度，起到净化水质与减少赤潮发生的效用。