引起澄清苹果汁浑浊沉淀的主要原因是加工过程中澄清处理不当、杀菌不彻底或杀菌后微生物再污染。
1、由于微生物活动并生产多种代谢物，而导致浑浊沉淀。
2、苹果汁中的悬浮颗粒以及易沉淀物质未充分去除，在杀菌后储藏期间会继续沉淀。
3、加工用水未达到饮料用水标准，带来沉淀和浑浊物质。
4、金属离子与苹果汁中的有关物质发生反应产生沉淀。
5、调配时糖和其他物质质量差，可能会有导致浑浊沉淀的杂质。
6、香精水溶性低或用量过大，从果汁中分离出来引起沉淀。