隔离环境设施采用无菌隔离器以保证无菌或无外来污染物。隔离器内的空气、饲料、水、垫料和设备均是无菌的，为了保证这种无菌状态，人不能和动物直接接触，工作人员通过附着于隔离器上的橡胶手套进行操作。隔离器的空气进入要经过超高效过滤0.5um微粒，滤除率99．97％），一切物品包装灭菌后通过灭菌传递舱移入，动物来自无菌动物、或其哺育的剖腹产动物后代。该系统的设施适用于饲育无菌们（GermFree）级及SPF级实验动物。