柔性防水屋面是用防水卷材与胶粘剂结合在一起的，形成连续致密的构造层，从而达到防水的目的。其基本构造层次由下至上依次为：结构层、找平层、结合层、防水层、保护层。
结构层：多为钢筋混凝土屋面板，可以是现浇板或预制板
找平层：卷材防水层要求铺贴在坚固而平整的基层上，以防止卷材凹陷或断裂，因而在松软材料上应设找平层；找平层的厚度取决于基层的平整度，一般采用20mm厚1：3水泥砂浆，也可采用1：8沥青砂浆等。
结合层：作用是在基层与卷材胶粘剂间形成一层胶质薄膜，使卷材与基层胶结牢固。沥青类卷材通常用冷底子油作结合层；高分子卷材则多采用配套基层处理剂，也可用冷底子油或稀释乳化沥青作结合层。
防水层：可采用高聚物改性沥青防水层或高分子卷材防水层。
保护层：设置保护层的目的是保护防水层。保护层的构造做法应视屋面的利用情况而定。
另外，还有其它辅助层次，是根据屋盖的使用需要或为提高屋面性能而补充设置的构造层。其中，找坡层是材料找坡屋面为形成所需排水坡度而设；保温层是为防止夏季或冬季气候使建筑顶部室内过热或过冷而设；隔蒸汽层是为防止潮汽侵入屋面保温层，使其保温功能失效而设等