球虫只需一个宿主，它的发育过程包括内生性发育和外生性发育。内生性发育包括在宿主体内进行的裂体生殖和配子生殖两个阶段；外生性发育是指在外界环境中完成的孢子生殖阶段：即随粪便排出的未孢子化卵囊在外界合适的温度和湿度条件下，在24～48h内发育为感染性卵囊（也称孢子化卵囊）。易感动物吞食了已孢子化的卵囊后，子孢子逸出，进入上皮细胞内，变为多核的裂殖体，之后形成许多裂殖子，再侵入新的上皮细胞，重复进行裂体生殖（裂殖体←→裂殖子）。如此几代后，一部分裂殖子在宿主上皮细胞内发育为大小配子体。继而产生大小配子，形成合子，产生未孢子化卵囊随粪排出宿主体。
诊断时多用饱和盐水漂浮法检查粪便和肠粘膜刮取物中有否球虫卵囊。根据其种类、数量及患病动物临床表现和流行病学资料进行分析判定，必要时配合剖解加以确诊。
防治中应该注意以下问题：即为避免耐药性的产生，延长抗球虫药的使用时间，用药时可采取轮换用药（一种药物连续用几个月后改用另一种药物）和或穿梭用药（雏鸡料添加一种药物，继之在生长、肥育料内添加另一种化学特性不同的药物）方案。此外，还要注意有的药物在使用时有休药期问题