1、产品丰富：产品的多样性导致分离方法的多样性；
2、绝大多数生物分离方法来源于化学分离；
3、生物分离一般比化工分离难度大：
（1）成分复杂
（2）悬液中的目标产物浓度低
（3）生物活性，条件相对温和
（4）生物产品要求高质量
（5）获得高纯度的干燥产品
（6）卫生因此，生物分离过程往往成本很高，在某些产品的生产过程中，分离成本可能占到总成本的80％以上。因此必须仔细考虑和设计产品的回收和纯化过程。