中世纪基督教哲学指的是一种由基督徒自觉地以基督教信仰为指导，但又通过人的自然理性论证其原理而建构的哲学形态。基督教哲学与希腊哲学形成了鲜明的对比。
1、理性与信仰的关系问题。基督教哲学始终处在理性与信仰的矛盾之中。诉诸于信仰的宗教神学具有绝对的权威，然而哲学的思辨却需要理性的力量。基督教哲学试图调和两者，用理性来证明信仰。但是由于两者在根本上是矛盾的，因此最终不仅损害了信仰，也失落了理性。
2、超验性。基督教哲学向人们展示了一个无限的超验世界，开拓并丰富了人类的精神世界。
3、内在性。墓督教使无限的精神（实体）具体化在个人的心灵之中，它诉诸于个人的内心信仰，主张灵魂的得救必需每个人的灵魂在场。
4、自由的问题。自由意志问题始终是基督教思想中的难题。
5、超自然主义的观念。基督教思想中自然不但没有神性，而且是上帝为人类所创造的可供其任意利用的死东西。基督教的观念使后人在认识世界之外亦树立了改造世界的观念。
教会虽然伴随着世俗化对社会产生了越来越多的不良影响，但是对于保存文明火种起到了积极作用。