（1）、加强政权建设。明朝初年，中央和地方的政治建制基本承袭元朝，中央设中书省，置左，右丞相；洪武九年六月，明太祖废除行省；在全国陆续设置了13个承宣政使司，置左，右布政使各一人，主管一省的民政和财政。另设提刑按察使司，掌管司法；设都指挥使司，掌管地方军政，三者合称“三司”，互不统属，分别归辖于中央相关部分。这样将地方的权力分化，使三个机构互相监督，避免地方的割据势力。随后，明太祖裁撤中书省，罢丞相，权分六部，六部尚书听命于皇上，直接对皇帝负责。洪武十五年，又仿宋制设置殿阁大学士，由文人充任，批阅奏章，以备顾问。到明成祖时，内阁正式形成。
（2）、改进监察制度。都察院下设十三道监察御史，职纠内外官员，官阶虽低，权威甚重。给事中制度是独立于都察院之外的一套监察体系。负责稽查各部。
（3）、创立五军都督府和卫所制度。洪武初年，由大都督府的大都督节制中外诸军，洪武十三年正月，改大都督府为中、左、右前后五军都督府，分领在京的除亲军外的各卫所和在外的各都司。五军府所管仅是军籍和军政，军队的调遣和最高指挥权仍在皇帝。在军队的编制上，自京师至地方皆设立卫所，卫所官军皆为世袭，京师卫军分由五军府分统的内卫和皇帝亲军系统，卫所军队来源是世袭军户，征兵，归附兵长生军和从平片中征调的垛集军。
（4）、抑制豪强，整顿吏治。明太祖针对地主富豪多聚族而居的特点，多次大量地把他们迁往他乡，使这些豪强失去了原有的社会基础。太祖十分重视吏治的整顿，严禁各级官吏玩忽职守，渎政害民，高级官员要接受御史的监督，中下级官吏定期考核，称职者升，平常的复任，不称职者降，品德卑劣的罢职为民。洪武十三年和洪武二十六年，明太祖两次大兴党狱，不但元勋宿将被杀殆尽，而且许多江南豪族也被诛杀。
（5）、兴办学校，扩大科举。明代的学校大体有三类：国子学，府县学和村镇的民间社学，采用科举的办法选官；考试以四书、五经的文章命题，以程，朱的解释为依据，间用古注疏，文章的格式规定为八股文。
（6）、加强法制。洪武三十年正式颁布《大明律》维护君主尊严和权力，洪武十八年十一月，太祖颁布亲自编撰的《大诰》，随后，又颁行了《大诰续编》、《大诰三编》，汇集了大量惩治官民贪赃受贿，转假赋役，侵吞税粮，抗租误役，流亡隐匿和使用凌迟、枭首等重刑的案例，其目的是作为和《大明律》并行的司法依据。它是太祖重典治吏政策实践的反映。
（7）、实行特务统治，以禁止内臣干政。太祖时设锦衣卫，成祖时设东厂。宪宗时设西厂。三者只对皇帝负责，毋需经司法机关批准即可随意缉拿官民。