形态突变型——细胞形态变化或菌落形态变化。如菌落颜色变化，菌体失去荚膜、鞭毛等。
营养缺陷型——因突变而丧失产生某种生物合成酶的能力，必须在培养基中添加某种物质才能生长的突变类型。野生型和缺陷型分别用+、-表示，如分别用his+和his-表示组氨酸野生型和缺陷型。
抗性突变型——因突变而产生了对某种化学药物或致死物理因子的抗性。抗性和敏感型分别用r和s表示，如用strr和strs分别表示链霉素抗性和敏感性。
条件致死突变型——突变后在某种条件下可正常生长繁殖，而在另一条件下却无法生长繁殖的突变型。（温度敏感突变株ts）