脊柱结核的鉴别诊断是：
（1）强直性脊柱炎：本病均有骶髂关节炎症，没有全身中毒症状，X线检查看不到骨破坏与死骨，胸椎受累后会出现胸廓扩张受限等临床表现。
（2）化脓性脊柱炎：发病急，有高热及明显疼痛，进展快，早期血培养可检出致病菌。
（3）腰椎间盘突出症：无全身症状，有下肢神经根受压症状，血沉不快，CT检查可发现突出的髓核。
（4）脊柱肿瘤：多见于老年人，疼痛逐日加重，X线片可见骨破坏累及椎弓根，椎间隙高度正常，一般没有椎旁软组织块影。
（5）嗜酸性肉芽肿：多见于胸椎，患者年龄通常不满12岁，整个椎体均匀性压扁，呈线条状，上下椎间隙完全正常，没有发热等全身症状。
（6）退行性脊椎骨关节病：为老年性疾病，椎间隙普遍变窄，邻近椎体上下缘硬化发白，有骨桥形成，没有骨质破坏与全身症状。