在人体内（进行裂体生殖）：
红血细胞前期：当被感染的雌按蚊叮人时，其体内的子孢子随唾液进入人体，随血液到达人体肝脏，在肝脏中进行裂体生殖，危害肝细胞。放出裂殖子。
红血细胞外期：由肝细胞中放出的一部分裂殖子再次进入肝细胞，在其中进行裂体生殖。但有人认为无此期。
红血细胞内期：由肝细胞中放出的另一部分裂殖子进入红血细胞，在红血细胞中进行裂体生殖，在进行多次裂体生殖后，由裂殖子发育成大、小配子母细胞。这时须转移寄主。
在按蚊体内（进行配子生殖和孢子生殖）：
人体内的间日疟原虫的大、小配子母细胞被按蚊吸去，在蚊的胃腔内进行有性生殖，大、小配子母细胞形成配子，然后大、小配子结合形成合子，它穿入蚊的胃壁，发育成卵囊（孢子），其内的核及胞质进行多次分裂，形成大量的子孢子（孢子生殖），卵囊破裂把子孢子放出到蚊的体腔中，有子孢子的体腔液最后到达蚊的唾液中，准备感染新的人。