(1)短暂性脑缺血发作(TIA)和可逆性缺血性脑疾病(PRIND)，可以显示患者在症状恢复后依然存在局部脑血流量降低的状态，灵敏度和特异性高，有重要的评价预后价值，有助于发现高危患者。
(2)癫痫灶探测和定位，阳性率高，准确可靠。
(3)脑梗死，用于发病48小时内早期诊断。
(4)脑损伤，病灶发病率高。
脑灌注显像还可用于：①脑瘤：了解脑瘤的血共情况，指导化疗。②Alzheimer型痴呆诊断和鉴别诊断；Huntington舞蹈病，可再CT发现尾状核萎缩之前显示尾状核血流和功能降低。