医学设备经济管理中应特别注意对以下几方面问题的管理：
（1）融资渠道：装备引进和运行需要强有力的资金保证，特别引进大型精密贵重装备，初始投资量大，因此，装备经济管理的首要任务就是融资。现阶段，融资渠道主要有医院基金、政府投资、贷款、捐赠、折旧费和残值、实物融资等。实物融资主要是指在装备初始投资时，医院无需一次性投资，采用装备租赁、有偿占用等方法，直接从所有权方获得装备，尔后用装备产出的经济收入或科学研究成果对所有权方进行补偿。实物融资的优势是可缓解医院财政流动资金不足，提前引进先进的医疗诊治装备。
（2）合理配置资源：医学装备是经济资源。有限的经济资源与无限的需求是永恒的矛盾，合理配置资源是解决这一矛盾的前提和重要方法。装备配置合理就是有限的资源发挥了最大的效能。合理配置装备的关键是根据医院发展规划和医疗服务市场需求制定科学的装备年度计划，严防盲目采购的短期行为，提高装备投入的效益。
（3）成本效益分析：装备成本指在装备寿命周期内投入的全部物质资源和劳动资源，并用货币计量。装备效益包括社会效益和经济效益。成本效益分析是选好装备、合理分配装备、充分利用装备的常用方法。由于社会效益具有非经济性和不能用经济尺度进行计量的特征，因此成本效益分析的实质是经济投入和经济效益的比较。