控制无关变量的方法，主要有三种：消除法，恒定法，平衡法。
消除法是通过采取一定措施，将影响研究结果的各种无关变量消除掉。它是控制无关变量的理想方法和基本方法。消除无关变量的方法多种多样，根据无关变量产生的原因的不同而有所不同。
恒定法是采取一定措施，使某些无关变量在整个研究过程中保持恒定不变。它也是一种基本方法。
平衡法就是对某些不能被消除，又不能或不便被恒定的无关变量，通过采取某些综合平衡的措施或方式，使其影响通过平衡而抵消，达到控制它们的方法。平衡法主要采用对比组方法和循环法。