⑴巴甫洛夫条件反射中的个体活动，是由某种明显可见的刺激激发的，形成了典型的S－R序列。相反，在利用斯金纳箱的操作反射实验中，动物行为的产生不需要明显的外界刺激来引发；
⑵操作条件反射中的个体，必须作用于个体所处的环境，必须自己按动杠杆才能得到食物的强化。巴甫洛夫的条件反射的个体只是被动地对实验者的信号作出应答反应。即前者行为带有主动性，后者的行为则带有被动性。
⑶是对神经系统生理作用的看法。巴甫洛夫的条件反射强调高级的神经活动对个体外在行为的支配作用。斯金纳的操作反射则只注意环境对个体的强化。