湿热灭菌：在密闭的蒸锅内，蒸汽不能外溢，压力不断上升，使水的沸点不断提高，从而锅内温度也随之增加。在0.1MPa的压力下，锅内温度达到121℃。在此蒸汽温度下，可以很快杀死各种细菌及其高度耐热的芽孢（穿透力强）。
干热灭菌：利用烘箱烘烤灭菌，温度与灭菌时间成反比，一般设定160℃，灭菌时间2-3h，主要用于玻璃器皿的灭菌。
过滤灭菌：用细菌不能通过致密具孔滤材的原理以除去气体或液体中微生物的方法。常用于气体、热不稳定的药品溶液或原料的除菌。